Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF3O75054 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms