Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3KRW8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3KRW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3KRW8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KRW8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KRW8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KRW8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KRW8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KRW8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KRW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KRW8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KRW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3KRW8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3KRW8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3KRW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
J3KRW8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
J3KRW8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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