Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NECAP2Q9NVZ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms