Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP86

CABP5, Calcium-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP5Q9NP86 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP5Q9NP86 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP5Q9NP86 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP5Q9NP86 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP5Q9NP86 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CABP5Q9NP86 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CABP5Q9NP86 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CABP5Q9NP86 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms