Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCLK3Q9C098 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms