Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM106CQ9BVX2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM106CQ9BVX2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms