Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC47Q96A33 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC47Q96A33 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms