Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
TOPBP1Q92547 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOPBP1Q92547 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms