Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5H1

TY1A-PR3, Transposon Ty1-PR3 Gag polyprotein, yeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY1A-PR3	Q6Q5H1	HUR1	YGL168W	333 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ASK1	YKL052C	879 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SVS1	YPL163C	783 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SUE1	YPR151C	621 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	XKS1	YGR194C	1803 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MNS1	YJR131W	1650 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	KRE2	YDR483W	1329 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RTT109	YLL002W	1311 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	AMD1	YML035C	2433 nt		4.92	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ERG11	YHR007C	1593 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	BNA7	YDR428C	786 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tL(UAA)B1	tL(UAA)B1	84 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tL(UAA)B2	tL(UAA)B2	84 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tL(UAA)D	tL(UAA)D	84 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SUP51	tL(UAA)J	84 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tL(UAA)K	tL(UAA)K	84 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tL(UAA)L	tL(UAA)L	84 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	tL(UAA)N	tL(UAA)N	84 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MPC3	YGR243W	441 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FMC1	YIL098C	468 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TPM2	YIL138C	486 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ACF4	YJR083C	930 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NMA1	YLR328W	1206 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ATP18	YML081C-A	180 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SWS2	YNL081C	432 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YNL235C	YNL235C	432 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SWM2	YNR004W	441 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPS19A	YOL121C	435 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPL185W	YPL185W	396 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MCP2	YLR253W	1710 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RTC5	YOR118W	1704 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	HOM3	YER052C	1584 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TYW1	YPL207W	2433 nt		4.91	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ECM32	YER176W	3366 nt		4.9	□□□□□ -1.62
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SEC4	YFL005W	648 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CDC43	YGL155W	1131 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PRE9	YGR135W	777 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPL8A	YHL033C	771 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YNK1	YKL067W	462 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CDC42	YLR229C	576 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YLR287C	YLR287C	1068 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YMR153C-A	YMR153C-A	336 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YOR186W	YOR186W	435 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MRPL40	YPL173W	894 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	HPA2	YPR193C	471 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	IMD2	YHR216W	1572 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	BOI2	YER114C	3123 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NEL1	YHR035W	1893 nt		4.9	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GRS1	YBR121C	2004 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PAL1	YDR348C	1500 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	UBP16	YPL072W	1500 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPD1	YDL235C	504 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PRM8	YGL053W	714 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SPO13	YHR014W	876 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	IES3	YLR052W	753 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YLR101C	YLR101C	396 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	STM1	YLR150W	822 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YLR358C	YLR358C	564 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GLO1	YML004C	981 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RRN9	YMR270C	1098 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PBI2	YNL015W	228 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CAT5	YOR125C	702 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	snR24	snR24	89 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ADE3	YGR204W	2841 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PIF1	YML061C	2580 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	DAS1	YJL149W	1992 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MAG2	YLR427W	2013 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PWP1	YLR196W	1731 nt		4.89	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	BRF1	YGR246C	1791 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SNU56	YDR240C	1479 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	AZR1	YGR224W	1842 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ALE1	YOR175C	1860 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CYK3	YDL117W	2658 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPC11	YDR045C	333 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ECL1	YGR146C	636 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YGR190C	YGR190C	366 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RTT102	YGR275W	474 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TRR2	YHR106W	1029 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SDL1	YIL167W	633 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YKT6	YKL196C	603 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	VPS51	YKR020W	495 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YLR224W	YLR224W	1110 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NGL1	YOL042W	1092 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ETR1	YBR026C	1143 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPS11B	YBR048W	471 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TRE1	YPL176C	2352 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ZUO1	YGR285C	1302 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RTT106	YNL206C	1368 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	DSL1	YNL258C	2265 nt		4.88	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	KCC4	YCL024W	3114 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SEC27	YGL137W	2670 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RFT1	YBL020W	1725 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ATG31	YDR022C	591 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TFB3	YDR460W	966 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	HLR1	YDR528W	1272 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YGR176W	YGR176W	348 nt		4.87	□□□□□ -1.63
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YGR228W	YGR228W	345 nt		4.87	□□□□□ -1.63

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