Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCTN1Q2MV58 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TCTN1Q2MV58 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCTN1Q2MV58 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms