Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLS1Q14651 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PLS1Q14651 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLS1Q14651 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLS1Q14651 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLS1Q14651 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLS1Q14651 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms