Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POU5F1Q01860 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU5F1Q01860 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU5F1Q01860 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POU5F1Q01860 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU5F1Q01860 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU5F1Q01860 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU5F1Q01860 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU5F1Q01860 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU5F1Q01860 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POU5F1Q01860 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms