Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00205P59089 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms