Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCP110O43303 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCP110O43303 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCP110O43303 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCP110O43303 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCP110O43303 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCP110O43303 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCP110O43303 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCP110O43303 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCP110O43303 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCP110O43303 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCP110O43303 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCP110O43303 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCP110O43303 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCP110O43303 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCP110O43303 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCP110O43303 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCP110O43303 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCP110O43303 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCP110O43303 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCP110O43303 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCP110O43303 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCP110O43303 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCP110O43303 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCP110O43303 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCP110O43303 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCP110O43303 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCP110O43303 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCP110O43303 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCP110O43303 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCP110O43303 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCP110O43303 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCP110O43303 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCP110O43303 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCP110O43303 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCP110O43303 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCP110O43303 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCP110O43303 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCP110O43303 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCP110O43303 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms