Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SMCO3A2RU48 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO3A2RU48 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms