Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRP12Q9Y561 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LRP12Q9Y561 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms