Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC4BQ9NT99 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms