Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM42Q9BTD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms