Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMOQ99835 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMOQ99835 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMOQ99835 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMOQ99835 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMOQ99835 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMOQ99835 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMOQ99835 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMOQ99835 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMOQ99835 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMOQ99835 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMOQ99835 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMOQ99835 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms