Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms