Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACAP3Q96P50 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACAP3Q96P50 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 426.2 ms