Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TOPBP1Q92547 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOPBP1Q92547 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TOPBP1Q92547 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms