Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
WASHC2DQ5SRD0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms