Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 FAT1YBR041W 2010 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 GRX3YDR098C 858 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 YEL074WYEL074W 339 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 FOL2YGR267C 732 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 SRP40YKR092C 1221 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 URA4YLR420W 1095 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 TEX1YNL253W 1269 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 NDJ1YOL104C 1059 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 RPS11BYBR048W 471 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 YBR096WYBR096W 693 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 NRP1YDL167C 2160 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE3Q12074 ROD1YOR018W 2514 nt3.84□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 SMI1YGR229C 1518 nt3.84□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 SWI1YPL016W 3945 nt3.84□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 RSF2YJR127C 4143 nt3.84□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 AEP3YPL005W 1821 nt3.84□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 PPZ1YML016C 2079 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 MTC4YBR255W 2085 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YCR015CYCR015C 954 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YDL186WYDL186W 834 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 KEG1YFR042W 603 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YGR026WYGR026W 837 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 PET130YJL023C 1044 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 MDJ2YNL328C 441 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YBL096CYBL096C 309 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YIG1YPL201C 1386 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 ACA1YER045C 1470 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 CUE3YGL110C 1875 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 SDS23YGL056C 1584 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 TAF6YGL112C 1551 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 SER3YER081W 1410 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YGR117CYGR117C 1431 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 ALG1YBR110W 1350 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 GTT1YIR038C 705 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 IES3YLR052W 753 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 IDP2YLR174W 1239 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 COQ5YML110C 924 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 NIS1YNL078W 1224 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 IRC14YOR135C 342 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 USV1YPL230W 1176 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 ORC4YPR162C 1590 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 TRM12YML005W 1389 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 BSC2YDR275W 708 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 WBP1YEL002C 1293 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 LAC1YKL008C 1257 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 IRC25YLR021W 540 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YLR444CYLR444C 303 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YMR178WYMR178W 825 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 PRM15YMR278W 1869 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 KRE5YOR336W 4098 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 TSR1YDL060W 2367 nt3.81□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 IMD4YML056C 1575 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 JEN1YKL217W 1851 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 DSS1YMR287C 2910 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 HOM2YDR158W 1098 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 FCF1YDR339C 570 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 IMP3YHR148W 552 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 SDS3YIL084C 984 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 MRPL49YJL096W 486 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 SOP4YJL192C 705 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 GTT2YLL060C 702 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 MED11YMR112C 396 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YOR263CYOR263C 408 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 FYV5YCL058C 459 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 ERB1YMR049C 2424 nt3.8□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 CTM1YHR109W 1758 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 RDS1YCR106W 2499 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 AIM6YDL237W 1173 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 RPS13YDR064W 456 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YGR051CYGR051C 324 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 POG1YIL122W 1056 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 RIB4YOL143C 510 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 SLM2YNL047C 1971 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 AVT7YIL088C 1473 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 ZDS1YMR273C 2748 nt3.79□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 ISM1YPL040C 3009 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 GAC1YOR178C 2382 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 SWH1YAR042W 3567 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 HFD1YMR110C 1599 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 EBP2YKL172W 1284 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 YOL166CYOL166C 339 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 CAF20YOR276W 486 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 MUM2YBR057C 1101 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 HCA4YJL033W 2313 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 MCM7YBR202W 2538 nt3.78□□□□□ -1.8
SPE3Q12074 SEC59YMR013C 1560 nt3.77□□□□□ -1.81
SPE3Q12074 YGL140CYGL140C 3660 nt3.77□□□□□ -1.81
SPE3Q12074 RDI1YDL135C 609 nt3.77□□□□□ -1.81
SPE3Q12074 YAL004WYAL004W 648 nt3.77□□□□□ -1.81
SPE3Q12074 TMA19YKL056C 504 nt3.77□□□□□ -1.81
SPE3Q12074 YLR156WYLR156W 345 nt3.77□□□□□ -1.81
SPE3Q12074 YLR159WYLR159W 345 nt3.77□□□□□ -1.81
SPE3Q12074 YLR161WYLR161W 345 nt3.77□□□□□ -1.81
SPE3Q12074 YOL019WYOL019W 1656 nt3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.1 ms