Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIRE1Q08AE8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPIRE1Q08AE8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms