Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YAL004W	YAL004W	648 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YLR156W	YLR156W	345 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YLR159W	YLR159W	345 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YLR161W	YLR161W	345 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	FOL3	YMR113W	1284 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	TPM1	YNL079C	600 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	GIS2	YNL255C	462 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	AIM39	YOL053W	1188 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	REX4	YOL080C	870 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YPK3	YBR028C	1578 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	STE6	YKL209C	3873 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	STE23	YLR389C	3084 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	NUP85	YJR042W	2235 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	CIT1	YNR001C	1440 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	KIP3	YGL216W	2418 nt		3.35	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	CDC26	YFR036W	375 nt		3.35	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	SDT1	YGL224C	843 nt		3.35	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RAI1	YGL246C	1164 nt		3.35	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	SPT4	YGR063C	309 nt		3.35	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YLR225C	YLR225C	1224 nt		3.35	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	VPS28	YPL065W	729 nt		3.35	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		3.35	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	STU2	YLR045C	2667 nt		3.35	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RAD7	YJR052W	1698 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	NKP1	YDR383C	717 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RPS21A	YKR057W	264 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	SDO1	YLR022C	753 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	INN1	YNL152W	1230 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YOR338W	YOR338W	1092 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RPA43	YOR340C	981 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	FDH2	YPL275W	711 nt		3.34	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.34	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	IMH1	YLR309C	2736 nt		3.34	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	TRM1	YDR120C	1713 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	DTD1	YDL219W	453 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	CAP2	YIL034C	864 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YAL065C	YAL065C	387 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	snR42	snR42	351 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	TSR1	YDL060W	2367 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	TDA3	YHR009C	1572 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	AIM14	YGL160W	1713 nt		3.33	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	MIT1	YEL007W	2001 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YEL025C	YEL025C	3567 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	BMS1	YPL217C	3552 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	POL3	YDL102W	3294 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	ARC15	YIL062C	465 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YJR037W	YJR037W	384 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	APC9	YLR102C	798 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YNL320W	YNL320W	855 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	CAT5	YOR125C	702 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	NIP7	YPL211W	546 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	TIM12	YBR091C	330 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	PRS5	YOL061W	1491 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	PTM1	YKL039W	1572 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	CHA4	YLR098C	1947 nt		3.32	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	SKP2	YNL311C	2292 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	RPL30	YGL030W	318 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YIL089W	YIL089W	618 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	SOD1	YJR104C	465 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	ARG80	YMR042W	534 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	GOT1	YMR292W	417 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	RUF21	RUF21	707 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	MDJ2	YNL328C	441 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YNR071C	YNR071C	1029 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	RPA190	YOR341W	4995 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	PAM1	YDR251W	2493 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	DNM1	YLL001W	2274 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	VTC4	YJL012C	2166 nt		3.31	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	PEP7	YDR323C	1548 nt		3.3	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	UTP25	YIL091C	2166 nt		3.3	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	PSF1	YDR013W	627 nt		3.3	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YGR017W	YGR017W	894 nt		3.3	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	PSF3	YOL146W	585 nt		3.3	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.3	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YPL071C	YPL071C	471 nt		3.3	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	RPN2	YIL075C	2838 nt		3.3	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YBR238C	YBR238C	2196 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	PRP3	YDR473C	1410 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	GPI10	YGL142C	1851 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	CLB5	YPR120C	1308 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	PUG1	YER185W	912 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	GCD14	YJL125C	1152 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YSF3	YNL138W-A	258 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	RPL18A	YOL120C	561 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	DDP1	YOR163W	567 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	BMT2	YBR141C	1014 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	MRPS9	YBR146W	837 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	EMC1	YCL045C	2283 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	REC8	YPR007C	2043 nt		3.29	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	JIP5	YPR169W	1479 nt		3.28	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YTA7	YGR270W	4140 nt		3.28	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YHR080C	YHR080C	4038 nt		3.28	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	SPT16	YGL207W	3108 nt		3.28	□□□□□ -1.88
ATG12	P38316	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.28	□□□□□ -1.88

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