Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2E1P29083 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms