Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB4P28070 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB4P28070 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms