Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP19O94966 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP19O94966 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP19O94966 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP19O94966 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP19O94966 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP19O94966 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP19O94966 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP19O94966 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP19O94966 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP19O94966 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP19O94966 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP19O94966 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP19O94966 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP19O94966 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP19O94966 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP19O94966 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP19O94966 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP19O94966 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP19O94966 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP19O94966 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP19O94966 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP19O94966 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP19O94966 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP19O94966 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP19O94966 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP19O94966 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP19O94966 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP19O94966 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP19O94966 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP19O94966 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms