Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGSF3O75054 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms