Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARID3CA6NKF2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ARID3CA6NKF2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ARID3CA6NKF2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms