Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 SPOUT1-203ENST00000467396 451 ntTSL 212.86□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-218ENST00000487109 8031 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-208ENST00000459850 8073 ntTSL 1 (best)12.05□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABHD2-202ENST00000562073 588 ntTSL 510.59□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 HDAC1-202ENST00000428704 664 ntTSL 29.88□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 HDAC1-205ENST00000472928 532 ntTSL 27.03□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 GTF2I-209ENST00000484840 574 ntTSL 46.26□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.446e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 CASP8AP2-204ENST00000548224 1300 ntTSL 514.27□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 RBM25-202ENST00000525161 541 ntTSL 411.74□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 NFYB-201ENST00000240055 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 PPFIA1-219ENST00000531657 3036 ntTSL 29.04□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 PPFIA1-215ENST00000530548 3774 ntTSL 27.28□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 CASP8AP2-201ENST00000237177 6719 ntTSL 57.26□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 PPFIA1-212ENST00000528853 745 ntTSL 36.53□□□□□ -1.366e-7■■■■■ 28.7
PUM1Q14671 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.348e-10■■■■■ 28.5
PUM1Q14671 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.428e-10■■■■■ 28.5
PUM1Q14671 RERE-216ENST00000505225 533 ntTSL 27.76□□□□□ -1.178e-10■■■■■ 28.5
PUM1Q14671 CCDC12-211ENST00000604367 2412 nt14.23□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 28.4
PUM1Q14671 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.366e-8■■■■■ 28.3
PUM1Q14671 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.196e-8■■■■■ 28.3
PUM1Q14671 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 28.3
PUM1Q14671 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 28.3
PUM1Q14671 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 28.3
PUM1Q14671 AP3D1-205ENST00000586370 911 ntTSL 27.7□□□□□ -1.182e-12■■■■■ 28.1
PUM1Q14671 FAM204A-201ENST00000369170 975 ntTSL 216.72■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 28.1
PUM1Q14671 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 28.1
PUM1Q14671 FAM204A-206ENST00000469758 1170 ntTSL 58.99□□□□□ -0.977e-7■■■■■ 28.1
PUM1Q14671 FAM204A-207ENST00000470476 1000 ntTSL 57.67□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 28.1
PUM1Q14671 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.667e-7■■■■■ 28.1
PUM1Q14671 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.765e-6■■■■■ 27.9
PUM1Q14671 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.485e-6■■■■■ 27.9
PUM1Q14671 RDX-211ENST00000530749 2558 ntTSL 220.6■□□□□ 0.895e-6■■■■■ 27.9
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PUM1Q14671 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.695e-6■■■■■ 27.9
PUM1Q14671 RDX-217ENST00000534683 562 ntTSL 417.27■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 27.9
PUM1Q14671 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 27.9
PUM1Q14671 RDX-209ENST00000530131 1911 ntTSL 214.23□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 27.9
PUM1Q14671 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 27.9
PUM1Q14671 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 27.7
PUM1Q14671 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.052e-11■■■■■ 27.7
PUM1Q14671 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 27.6
PUM1Q14671 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.79e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 MCM3AP-203ENST00000426537 876 ntTSL 222.91■■□□□ 1.269e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 AKT1-217ENST00000557494 408 ntTSL 222.87■■□□□ 1.259e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 TMC6-213ENST00000589933 580 ntTSL 322.7■■□□□ 1.229e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 KANK2-210ENST00000590685 923 ntTSL 421.68■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 PRRC2B-205ENST00000451855 1762 ntTSL 520.07■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.789e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 KANK2-212ENST00000592675 624 ntTSL 519.72■□□□□ 0.759e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.749e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.539e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 KANK2-203ENST00000588724 542 ntTSL 217.92■□□□□ 0.469e-7■■■■■ 27.5
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PUM1Q14671 KANK2-209ENST00000590400 1812 ntTSL 1 (best)16.83■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -09e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -09e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 ZNHIT1-203ENST00000485387 2898 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.49e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 PTBP1-211ENST00000587094 273 ntTSL 312.16□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 SF3B3-211ENST00000568291 1067 ntTSL 210.14□□□□□ -0.799e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.889e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 ZNHIT1-202ENST00000461205 571 ntTSL 39.27□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 ZNHIT1-204ENST00000492315 3958 ntTSL 28.93□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.199e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 SF3B3-209ENST00000567635 630 ntTSL 57.24□□□□□ -1.259e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 FAM204A-209ENST00000490048 646 ntTSL 25.23□□□□□ -1.579e-7■■■■■ 27.5
PUM1Q14671 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.284e-9■■■■■ 27.4
PUM1Q14671 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.882e-6■■■■■ 27.2
PUM1Q14671 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 27.2
PUM1Q14671 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 27.2
PUM1Q14671 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 27.2
PUM1Q14671 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 27.2
PUM1Q14671 MAPK12-206ENST00000488504 1785 ntTSL 521.05■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 27.2
PUM1Q14671 METAP2-208ENST00000549808 538 ntTSL 46.1□□□□□ -1.432e-12■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 27.1
PUM1Q14671 C1QBP-204ENST00000573406 767 ntTSL 220.35■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 27.1
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