Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMED1Q13445 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMED1Q13445 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMED1Q13445 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMED1Q13445 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMED1Q13445 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMED1Q13445 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMED1Q13445 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMED1Q13445 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMED1Q13445 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMED1Q13445 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMED1Q13445 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
TMED1Q13445 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMED1Q13445 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMED1Q13445 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMED1Q13445 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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