Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 HIP1YGR191W 1812 nt10.18□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 LSC2YGR244C 1284 nt10.17□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 RPS14BYJL191W 417 nt10.17□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 RTN2YDL204W 1182 nt10.16□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 RBG2YGR173W 1107 nt10.16□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 YKR005CYKR005C 1578 nt10.16□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 ATG15YCR068W 1563 nt10.15□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 PLB1YMR008C 1995 nt10.14□□□□□ -0.79
PUF2Q12221 YML089CYML089C 369 nt10.14□□□□□ -0.79
PUF2Q12221 CLB6YGR109C 1143 nt10.12□□□□□ -0.79
PUF2Q12221 YGR259CYGR259C 441 nt10.12□□□□□ -0.79
PUF2Q12221 UTH1YKR042W 1098 nt10.12□□□□□ -0.79
PUF2Q12221 TIF6YPR016C 738 nt10.12□□□□□ -0.79
PUF2Q12221 PRP4YPR178W 1398 nt10.11□□□□□ -0.79
PUF2Q12221 GAP1YKR039W 1809 nt10.1□□□□□ -0.79
PUF2Q12221 UME6YDR207C 2511 nt10.09□□□□□ -0.79
PUF2Q12221 SDH5YOL071W 489 nt10.08□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 NRT1YOR071C 1797 nt10.08□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.07□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.07□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 CAB5YDR196C 726 nt10.05□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 MET28YIR017C 564 nt10.05□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 YMR226CYMR226C 804 nt10.05□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 DPS1YLL018C 1674 nt10.05□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 YLR111WYLR111W 333 nt10.04□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 BOR1YNL275W 1731 nt10.02□□□□□ -0.8
PUF2Q12221 YGR012WYGR012W 1182 nt10.01□□□□□ -0.81
PUF2Q12221 TSC10YBR265W 963 nt10.01□□□□□ -0.81
PUF2Q12221 UTR1YJR049C 1593 nt10.01□□□□□ -0.81
PUF2Q12221 BMT6YLR063W 1098 nt9.98□□□□□ -0.81
PUF2Q12221 YLR279WYLR279W 390 nt9.98□□□□□ -0.81
PUF2Q12221 DIF1YLR437C 402 nt9.98□□□□□ -0.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 RAD23YEL037C 1197 nt9.97□□□□□ -0.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.96□□□□□ -0.82
PUF2Q12221 MSB4YOL112W 1479 nt9.95□□□□□ -0.82
PUF2Q12221 SNF1YDR477W 1902 nt9.94□□□□□ -0.82
PUF2Q12221 PRM5YIL117C 957 nt9.93□□□□□ -0.82
PUF2Q12221 ZTA1YBR046C 1005 nt9.93□□□□□ -0.82
PUF2Q12221 FIT3YOR383C 615 nt9.92□□□□□ -0.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 IRC24YIR036C 792 nt9.9□□□□□ -0.82
PUF2Q12221 YAR028WYAR028W 705 nt9.9□□□□□ -0.82
PUF2Q12221 RIB3YDR487C 627 nt9.89□□□□□ -0.83
PUF2Q12221 AAC1YMR056C 930 nt9.89□□□□□ -0.83
PUF2Q12221 MTG2YHR168W 1557 nt9.88□□□□□ -0.83
PUF2Q12221 SAM1YLR180W 1149 nt9.88□□□□□ -0.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 AKR2YOR034C 2250 nt9.86□□□□□ -0.83
PUF2Q12221 ALP1YNL270C 1722 nt9.84□□□□□ -0.83
PUF2Q12221 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.81□□□□□ -0.84
PUF2Q12221 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.81□□□□□ -0.84
PUF2Q12221 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.81□□□□□ -0.84
PUF2Q12221 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.81□□□□□ -0.84
PUF2Q12221 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.81□□□□□ -0.84
PUF2Q12221 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.81□□□□□ -0.84
PUF2Q12221 SAM35YHR083W 990 nt9.79□□□□□ -0.84
PUF2Q12221 BIO5YNR056C 1686 nt9.77□□□□□ -0.84
PUF2Q12221 SED1YDR077W 1017 nt9.76□□□□□ -0.85 RIP-Chip
PUF2Q12221 GND1YHR183W 1470 nt9.74□□□□□ -0.85
PUF2Q12221 LOT5YKL183W 921 nt9.74□□□□□ -0.85
PUF2Q12221 HIF1YLL022C 1158 nt9.74□□□□□ -0.85
PUF2Q12221 ALD4YOR374W 1560 nt9.74□□□□□ -0.85
PUF2Q12221 DBP1YPL119C 1854 nt9.72□□□□□ -0.85
PUF2Q12221 UGA4YDL210W 1716 nt9.71□□□□□ -0.85
PUF2Q12221 LIP1YMR298W 453 nt9.71□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 FCY21YER060W 1587 nt9.7□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 APT2YDR441C 546 nt9.69□□□□□ -0.86 RIP-Chip
PUF2Q12221 RAD51YER095W 1203 nt9.69□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 YBL086CYBL086C 1401 nt9.69□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 SMM1YNR015W 1155 nt9.69□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 YPL251WYPL251W 303 nt9.69□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 HXT1YHR094C 1713 nt9.68□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 ADH1YOL086C 1047 nt9.68□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 ALG12YNR030W 1656 nt9.67□□□□□ -0.86 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPI1YFR003C 468 nt9.66□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 YNR029CYNR029C 1290 nt9.65□□□□□ -0.86
PUF2Q12221 YJL195CYJL195C 702 nt9.64□□□□□ -0.87
PUF2Q12221 PRY1YJL079C 900 nt9.63□□□□□ -0.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 BRR1YPR057W 1026 nt9.62□□□□□ -0.87
PUF2Q12221 LEU9YOR108W 1815 nt9.61□□□□□ -0.87
PUF2Q12221 YMR103CYMR103C 363 nt9.61□□□□□ -0.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 FUN14YAL008W 597 nt9.6□□□□□ -0.87
PUF2Q12221 YLR349WYLR349W 507 nt9.6□□□□□ -0.87
PUF2Q12221 MEP3YPR138C 1470 nt9.59□□□□□ -0.87
PUF2Q12221 TOA2YKL058W 369 nt9.59□□□□□ -0.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 STE4YOR212W 1272 nt9.59□□□□□ -0.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 RIB2YOL066C 1776 nt9.59□□□□□ -0.87
PUF2Q12221 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.59□□□□□ -0.87
PUF2Q12221 SHY1YGR112W 1170 nt9.57□□□□□ -0.88
PUF2Q12221 RPM1RPM1 483 nt9.56□□□□□ -0.88
PUF2Q12221 YJL055WYJL055W 738 nt9.55□□□□□ -0.88
PUF2Q12221 UFO1YML088W 2007 nt9.55□□□□□ -0.88
PUF2Q12221 PBP1YGR178C 2169 nt9.54□□□□□ -0.88
PUF2Q12221 GND2YGR256W 1479 nt9.54□□□□□ -0.88
PUF2Q12221 HXT12YIL170W 1374 nt9.53□□□□□ -0.88
PUF2Q12221 CSM1YCR086W 573 nt9.52□□□□□ -0.89
PUF2Q12221 VRG4YGL225W 1014 nt9.52□□□□□ -0.89
PUF2Q12221 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.5□□□□□ -0.89
PUF2Q12221 SSN3YPL042C 1668 nt9.49□□□□□ -0.89
PUF2Q12221 YEL008WYEL008W 381 nt9.48□□□□□ -0.89
PUF2Q12221 MCH5YOR306C 1566 nt9.47□□□□□ -0.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 ADH7YCR105W 1086 nt9.47□□□□□ -0.89 RIP-Chip
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