Protein–RNA interactions for Protein: Q12094

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSR3Q12094 IRC9YJL142C 393 nt14.49□□□□□ -0.09
TSR3Q12094 TIF34YMR146C 1044 nt14.49□□□□□ -0.09
TSR3Q12094 ALF1YNL148C 765 nt14.48□□□□□ -0.09
TSR3Q12094 POP4YBR257W 840 nt14.47□□□□□ -0.09
TSR3Q12094 snR56snR56 88 nt14.46□□□□□ -0.09
TSR3Q12094 YOR139CYOR139C 393 nt14.46□□□□□ -0.09
TSR3Q12094 PTP1YDL230W 1008 nt14.45□□□□□ -0.1
TSR3Q12094 PCI8YIL071C 1335 nt14.42□□□□□ -0.1
TSR3Q12094 STB1YNL309W 1263 nt14.41□□□□□ -0.1
TSR3Q12094 SLI1YGR212W 1407 nt14.41□□□□□ -0.1
TSR3Q12094 HOS2YGL194C 1359 nt14.4□□□□□ -0.1
TSR3Q12094 TAP42YMR028W 1101 nt14.39□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 YMR181CYMR181C 465 nt14.38□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 SIS1YNL007C 1059 nt14.38□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 RPP2AYOL039W 321 nt14.38□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 MRI1YPR118W 1236 nt14.38□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 AQY1YPR192W 918 nt14.38□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 SPO16YHR153C 597 nt14.37□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 ATG29YPL166W 642 nt14.36□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 MTC7YEL033W 420 nt14.35□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.35□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.35□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 LIP1YMR298W 453 nt14.35□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 CAC2YML102W 1407 nt14.34□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 MAF1YDR005C 1188 nt14.34□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 YPL068CYPL068C 882 nt14.34□□□□□ -0.11
TSR3Q12094 YDR029WYDR029W 315 nt14.33□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 RSF1YMR030W 1131 nt14.33□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt14.33□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 ARC35YNR035C 1029 nt14.33□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 YOL037CYOL037C 354 nt14.33□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 YOL106WYOL106W 354 nt14.33□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 RPI1YIL119C 1224 nt14.32□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 SPC42YKL042W 1092 nt14.32□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 EMI2YDR516C 1503 nt14.31□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 ADK2YER170W 678 nt14.3□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 GCN5YGR252W 1320 nt14.29□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 RNQ1YCL028W 1218 nt14.28□□□□□ -0.12
TSR3Q12094 MER1YNL210W 813 nt14.27□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 APM1YPL259C 1428 nt14.26□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 ESC2YDR363W 1371 nt14.26□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 YFL019CYFL019C 354 nt14.26□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 YDR541CYDR541C 1035 nt14.25□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 POP6YGR030C 477 nt14.25□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 YLR407WYLR407W 687 nt14.25□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 YNL171CYNL171C 369 nt14.24□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 YDR220CYDR220C 294 nt14.23□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 NPL3YDR432W 1245 nt14.23□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 DID2YKR035W-A 615 nt14.22□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 RTG3YBL103C 1461 nt14.22□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 BRL1YHR036W 1416 nt14.22□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 YDL221WYDL221W 552 nt14.21□□□□□ -0.13
TSR3Q12094 JJJ3YJR097W 519 nt14.2□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 ART5YGR068C 1761 nt14.19□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 GFD2YCL036W 1701 nt14.18□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 GET2YER083C 858 nt14.17□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 COX2Q0250 756 nt14.17□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 TAF4YMR005W 1167 nt14.17□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 ARL3YPL051W 597 nt14.17□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 TIR4YOR009W 1464 nt14.17□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 RRP17YDR412W 708 nt14.16□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 SLZ1YNL196C 897 nt14.16□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 PCL10YGL134W 1302 nt14.15□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 CWC15YDR163W 528 nt14.15□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 YOR105WYOR105W 327 nt14.15□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 IRC15YPL017C 1500 nt14.15□□□□□ -0.14
TSR3Q12094 CDA2YLR308W 939 nt14.14□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 IDP3YNL009W 1263 nt14.14□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 DLD2YDL178W 1593 nt14.13□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 YMR147WYMR147W 672 nt14.13□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 YBR220CYBR220C 1683 nt14.13□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 PCD1YLR151C 1023 nt14.12□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 YNL228WYNL228W 777 nt14.12□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 BDF1YLR399C 2061 nt14.11□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 COG2YGR120C 789 nt14.1□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 COA2YPL189C-A 207 nt14.1□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 NSA1YGL111W 1392 nt14.09□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 YPR177CYPR177C 372 nt14.09□□□□□ -0.15
TSR3Q12094 CMS1YLR003C 876 nt14.08□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 RRD1YIL153W 1182 nt14.06□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.06□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 YMR090WYMR090W 684 nt14.06□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 UBC5YDR059C 447 nt14.05□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 RMD5YDR255C 1266 nt14.05□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 YCH1YGR203W 447 nt14.05□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 GTR1YML121W 933 nt14.05□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 PET9YBL030C 957 nt14.05□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 FES1YBR101C 873 nt14.05□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 SDH1YKL148C 1923 nt14.05□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 RTS2YOR077W 699 nt14.04□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 YPL041CYPL041C 624 nt14.04□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 TFB4YPR056W 1017 nt14.04□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 YDL121CYDL121C 450 nt14.03□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 YLR198CYLR198C 360 nt14.03□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 YLR281CYLR281C 468 nt14.03□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 FTH1YBR207W 1398 nt14.03□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 MGR3YMR115W 1506 nt14.02□□□□□ -0.16
TSR3Q12094 YKR104WYKR104W 921 nt14.02□□□□□ -0.17
TSR3Q12094 CTR1YPR124W 1221 nt14.02□□□□□ -0.17
TSR3Q12094 FSH1YHR049W 732 nt14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.3 ms