Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 PAC11YDR488C 1602 nt10.68□□□□□ -0.7
SHS1Q07657 YML089CYML089C 369 nt10.67□□□□□ -0.7
SHS1Q07657 ARP6YLR085C 1317 nt10.66□□□□□ -0.7
SHS1Q07657 HIP1YGR191W 1812 nt10.66□□□□□ -0.7
SHS1Q07657 PRO1YDR300C 1287 nt10.66□□□□□ -0.7
SHS1Q07657 CLB6YGR109C 1143 nt10.66□□□□□ -0.7
SHS1Q07657 PEX2YJL210W 816 nt10.64□□□□□ -0.71
SHS1Q07657 UTH1YKR042W 1098 nt10.64□□□□□ -0.71
SHS1Q07657 RTN2YDL204W 1182 nt10.6□□□□□ -0.71
SHS1Q07657 TIF6YPR016C 738 nt10.6□□□□□ -0.71
SHS1Q07657 ATG15YCR068W 1563 nt10.58□□□□□ -0.72
SHS1Q07657 YLR111WYLR111W 333 nt10.58□□□□□ -0.72
SHS1Q07657 NRT1YOR071C 1797 nt10.57□□□□□ -0.72
SHS1Q07657 MET28YIR017C 564 nt10.56□□□□□ -0.72
SHS1Q07657 SDH5YOL071W 489 nt10.56□□□□□ -0.72
SHS1Q07657 RAD23YEL037C 1197 nt10.55□□□□□ -0.72
SHS1Q07657 TSC10YBR265W 963 nt10.55□□□□□ -0.72
SHS1Q07657 GAP1YKR039W 1809 nt10.54□□□□□ -0.72
SHS1Q07657 PLB1YMR008C 1995 nt10.53□□□□□ -0.72
SHS1Q07657 CAB5YDR196C 726 nt10.52□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 YKR005CYKR005C 1578 nt10.52□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 YGR012WYGR012W 1182 nt10.51□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.5□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 NVJ2YPR091C 2313 nt10.49□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 YGR259CYGR259C 441 nt10.49□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 SAM1YLR180W 1149 nt10.49□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 HSP60YLR259C 1719 nt10.49□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 YLR279WYLR279W 390 nt10.48□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 FIT3YOR383C 615 nt10.46□□□□□ -0.73
SHS1Q07657 PRP4YPR178W 1398 nt10.44□□□□□ -0.74
SHS1Q07657 RIB3YDR487C 627 nt10.44□□□□□ -0.74
SHS1Q07657 DIF1YLR437C 402 nt10.42□□□□□ -0.74
SHS1Q07657 MSB4YOL112W 1479 nt10.42□□□□□ -0.74
SHS1Q07657 UTR1YJR049C 1593 nt10.39□□□□□ -0.75
SHS1Q07657 DPS1YLL018C 1674 nt10.38□□□□□ -0.75
SHS1Q07657 YAR028WYAR028W 705 nt10.37□□□□□ -0.75
SHS1Q07657 BMT6YLR063W 1098 nt10.34□□□□□ -0.75
SHS1Q07657 ZTA1YBR046C 1005 nt10.33□□□□□ -0.76
SHS1Q07657 MTG2YHR168W 1557 nt10.33□□□□□ -0.76
SHS1Q07657 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.32□□□□□ -0.76
SHS1Q07657 ALP1YNL270C 1722 nt10.32□□□□□ -0.76
SHS1Q07657 IRC24YIR036C 792 nt10.29□□□□□ -0.76
SHS1Q07657 AKR2YOR034C 2250 nt10.29□□□□□ -0.76
SHS1Q07657 BOR1YNL275W 1731 nt10.29□□□□□ -0.76
SHS1Q07657 PRM5YIL117C 957 nt10.27□□□□□ -0.77
SHS1Q07657 GND1YHR183W 1470 nt10.24□□□□□ -0.77
SHS1Q07657 SAM35YHR083W 990 nt10.23□□□□□ -0.77
SHS1Q07657 SNF1YDR477W 1902 nt10.23□□□□□ -0.77
SHS1Q07657 RAD51YER095W 1203 nt10.22□□□□□ -0.77
SHS1Q07657 LOT5YKL183W 921 nt10.22□□□□□ -0.77
SHS1Q07657 AAC1YMR056C 930 nt10.22□□□□□ -0.77
SHS1Q07657 ADH1YOL086C 1047 nt10.22□□□□□ -0.77
SHS1Q07657 YPI1YFR003C 468 nt10.21□□□□□ -0.77
SHS1Q07657 FCY21YER060W 1587 nt10.2□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 SED1YDR077W 1017 nt10.19□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 FUN14YAL008W 597 nt10.18□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 YJL195CYJL195C 702 nt10.18□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 YNR029CYNR029C 1290 nt10.18□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 YLR349WYLR349W 507 nt10.17□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 STE4YOR212W 1272 nt10.16□□□□□ -0.78
SHS1Q07657 SMM1YNR015W 1155 nt10.14□□□□□ -0.79
SHS1Q07657 DBP1YPL119C 1854 nt10.14□□□□□ -0.79
SHS1Q07657 APT2YDR441C 546 nt10.13□□□□□ -0.79
SHS1Q07657 LIP1YMR298W 453 nt10.12□□□□□ -0.79
SHS1Q07657 ALD4YOR374W 1560 nt10.12□□□□□ -0.79
SHS1Q07657 UGA4YDL210W 1716 nt10.12□□□□□ -0.79
SHS1Q07657 YBL086CYBL086C 1401 nt10.09□□□□□ -0.79
SHS1Q07657 HIF1YLL022C 1158 nt10.09□□□□□ -0.79
SHS1Q07657 YPL251WYPL251W 303 nt10.09□□□□□ -0.79
SHS1Q07657 PRY1YJL079C 900 nt10.08□□□□□ -0.8
SHS1Q07657 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.07□□□□□ -0.8
SHS1Q07657 HXT1YHR094C 1713 nt10.07□□□□□ -0.8
SHS1Q07657 HXT12YIL170W 1374 nt10.06□□□□□ -0.8
SHS1Q07657 LEU9YOR108W 1815 nt10.05□□□□□ -0.8
SHS1Q07657 BIO5YNR056C 1686 nt10.05□□□□□ -0.8
SHS1Q07657 YEL008WYEL008W 381 nt10.04□□□□□ -0.8
SHS1Q07657 RIB2YOL066C 1776 nt10.03□□□□□ -0.8
SHS1Q07657 BRR1YPR057W 1026 nt10.01□□□□□ -0.81
SHS1Q07657 ADH7YCR105W 1086 nt10□□□□□ -0.81
SHS1Q07657 MEP3YPR138C 1470 nt9.98□□□□□ -0.81
SHS1Q07657 YMR103CYMR103C 363 nt9.97□□□□□ -0.81
SHS1Q07657 ALG12YNR030W 1656 nt9.96□□□□□ -0.81
SHS1Q07657 CSM1YCR086W 573 nt9.96□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 VRG4YGL225W 1014 nt9.96□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 PAU15YIR041W 375 nt9.96□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 SHY1YGR112W 1170 nt9.95□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 TOA2YKL058W 369 nt9.95□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 UFO1YML088W 2007 nt9.95□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 YJL055WYJL055W 738 nt9.94□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 GPN2YOR262W 1044 nt9.94□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 CPD1YGR247W 720 nt9.93□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.91□□□□□ -0.82
SHS1Q07657 GND2YGR256W 1479 nt9.9□□□□□ -0.83
SHS1Q07657 PHO23YNL097C 993 nt9.89□□□□□ -0.83
SHS1Q07657 SSN3YPL042C 1668 nt9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms