Protein–RNA interactions for Protein: Q06549

CDD1, Cytidine deaminase, yeastyeast

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDD1Q06549 CLB6YGR109C 1143 nt10.51□□□□□ -0.73
CDD1Q06549 LSC2YGR244C 1284 nt10.51□□□□□ -0.73
CDD1Q06549 YML089CYML089C 369 nt10.49□□□□□ -0.73
CDD1Q06549 ARP6YLR085C 1317 nt10.49□□□□□ -0.73
CDD1Q06549 UTH1YKR042W 1098 nt10.48□□□□□ -0.73
CDD1Q06549 CAB5YDR196C 726 nt10.47□□□□□ -0.73
CDD1Q06549 TIF6YPR016C 738 nt10.47□□□□□ -0.73
CDD1Q06549 YLR111WYLR111W 333 nt10.45□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 NRT1YOR071C 1797 nt10.44□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 ATG15YCR068W 1563 nt10.44□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 SDH5YOL071W 489 nt10.44□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 PAC11YDR488C 1602 nt10.41□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 RAD23YEL037C 1197 nt10.41□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.41□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 PLB1YMR008C 1995 nt10.41□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 GAP1YKR039W 1809 nt10.4□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 MET28YIR017C 564 nt10.4□□□□□ -0.74
CDD1Q06549 RTN2YDL204W 1182 nt10.39□□□□□ -0.75
CDD1Q06549 YGR012WYGR012W 1182 nt10.39□□□□□ -0.75
CDD1Q06549 TSC10YBR265W 963 nt10.39□□□□□ -0.75
CDD1Q06549 SAM1YLR180W 1149 nt10.38□□□□□ -0.75
CDD1Q06549 YLR279WYLR279W 390 nt10.36□□□□□ -0.75
CDD1Q06549 YKR005CYKR005C 1578 nt10.35□□□□□ -0.75
CDD1Q06549 MSB4YOL112W 1479 nt10.32□□□□□ -0.76
CDD1Q06549 RIB3YDR487C 627 nt10.32□□□□□ -0.76
CDD1Q06549 HSP60YLR259C 1719 nt10.32□□□□□ -0.76
CDD1Q06549 YGR259CYGR259C 441 nt10.31□□□□□ -0.76
CDD1Q06549 YJL225CYJL225C 5277 nt10.28□□□□□ -0.76
CDD1Q06549 FIT3YOR383C 615 nt10.28□□□□□ -0.76
CDD1Q06549 UTR1YJR049C 1593 nt10.27□□□□□ -0.76
CDD1Q06549 DIF1YLR437C 402 nt10.27□□□□□ -0.77
CDD1Q06549 PRP4YPR178W 1398 nt10.26□□□□□ -0.77
CDD1Q06549 ZTA1YBR046C 1005 nt10.23□□□□□ -0.77
CDD1Q06549 MTG2YHR168W 1557 nt10.22□□□□□ -0.77
CDD1Q06549 DPS1YLL018C 1674 nt10.22□□□□□ -0.77
CDD1Q06549 RAD51YER095W 1203 nt10.21□□□□□ -0.77
CDD1Q06549 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.21□□□□□ -0.77
CDD1Q06549 YAR028WYAR028W 705 nt10.2□□□□□ -0.78
CDD1Q06549 ALP1YNL270C 1722 nt10.17□□□□□ -0.78
CDD1Q06549 AKR2YOR034C 2250 nt10.14□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 PRM5YIL117C 957 nt10.14□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 ADH1YOL086C 1047 nt10.14□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 GND1YHR183W 1470 nt10.13□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 BMT6YLR063W 1098 nt10.12□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 LOT5YKL183W 921 nt10.11□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 IRC24YIR036C 792 nt10.1□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 FUN14YAL008W 597 nt10.1□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.1□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 BOR1YNL275W 1731 nt10.1□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 SNF1YDR477W 1902 nt10.09□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 YJL195CYJL195C 702 nt10.09□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 YLR349WYLR349W 507 nt10.09□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 YNR029CYNR029C 1290 nt10.09□□□□□ -0.79
CDD1Q06549 YPI1YFR003C 468 nt10.08□□□□□ -0.8
CDD1Q06549 STE4YOR212W 1272 nt10.08□□□□□ -0.8
CDD1Q06549 FCY21YER060W 1587 nt10.07□□□□□ -0.8
CDD1Q06549 AAC1YMR056C 930 nt10.07□□□□□ -0.8
CDD1Q06549 SMM1YNR015W 1155 nt10.06□□□□□ -0.8
CDD1Q06549 APT2YDR441C 546 nt10.05□□□□□ -0.8
CDD1Q06549 UGA4YDL210W 1716 nt10.02□□□□□ -0.8
CDD1Q06549 SAM35YHR083W 990 nt10.02□□□□□ -0.81
CDD1Q06549 SED1YDR077W 1017 nt10.01□□□□□ -0.81
CDD1Q06549 DBP1YPL119C 1854 nt10□□□□□ -0.81
CDD1Q06549 LIP1YMR298W 453 nt9.98□□□□□ -0.81
CDD1Q06549 YPL251WYPL251W 303 nt9.97□□□□□ -0.81
CDD1Q06549 PRY1YJL079C 900 nt9.96□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 ALD4YOR374W 1560 nt9.96□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 RIB2YOL066C 1776 nt9.96□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 HIF1YLL022C 1158 nt9.95□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 YBL086CYBL086C 1401 nt9.95□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.94□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 YEL008WYEL008W 381 nt9.94□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 ADH7YCR105W 1086 nt9.93□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 HXT12YIL170W 1374 nt9.92□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 HXT1YHR094C 1713 nt9.91□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 BIO5YNR056C 1686 nt9.91□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 PAU15YIR041W 375 nt9.91□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 GPN2YOR262W 1044 nt9.91□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 LEU9YOR108W 1815 nt9.91□□□□□ -0.82
CDD1Q06549 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.89□□□□□ -0.83
CDD1Q06549 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.89□□□□□ -0.83
CDD1Q06549 BRR1YPR057W 1026 nt9.89□□□□□ -0.83
CDD1Q06549 YMR103CYMR103C 363 nt9.87□□□□□ -0.83
CDD1Q06549 MEP3YPR138C 1470 nt9.86□□□□□ -0.83
CDD1Q06549 CSM1YCR086W 573 nt9.86□□□□□ -0.83
CDD1Q06549 VRG4YGL225W 1014 nt9.86□□□□□ -0.83
CDD1Q06549 YJL055WYJL055W 738 nt9.86□□□□□ -0.83
CDD1Q06549 RPM1RPM1 483 nt9.86□□□□□ -0.83
CDD1Q06549 CPD1YGR247W 720 nt9.83□□□□□ -0.84
CDD1Q06549 TOA2YKL058W 369 nt9.83□□□□□ -0.84
CDD1Q06549 SHY1YGR112W 1170 nt9.82□□□□□ -0.84
CDD1Q06549 UFO1YML088W 2007 nt9.81□□□□□ -0.84
CDD1Q06549 ALG12YNR030W 1656 nt9.79□□□□□ -0.84
CDD1Q06549 GND2YGR256W 1479 nt9.79□□□□□ -0.84
CDD1Q06549 SSN3YPL042C 1668 nt9.77□□□□□ -0.85
CDD1Q06549 SAM3YPL274W 1764 nt9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms