Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHA12Q9UN75 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHA12Q9UN75 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHA12Q9UN75 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms