Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCOR1Q9UKL0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCOR1Q9UKL0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms