Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPREB3Q9UKI3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms