Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPG2Q9UBF2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms