Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC4BQ9NT99 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4BQ9NT99 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.7 ms