Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSEN34Q9BSV6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSEN34Q9BSV6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSEN34Q9BSV6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms