Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GORASP1Q9BQQ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms