Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PFDN5Q99471 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PFDN5Q99471 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms