Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTL3Q8N8U3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTL3Q8N8U3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms