Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.9 ms