Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C17orf53Q8N3J3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms