Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDKN3Q16667 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDKN3Q16667 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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