Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSHL1Q14406 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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